Det är läkarens skyldighet att skilja om infektion ligger bakom din diarré eller inte. Om diarréerna startade i samband med en vistelse utomlands, speciellt i Sydeuropa, Östeuropa och i så kallade utvecklings länder eller efter ha ätit viss mat, speciellt om flera individer insjuknar samtidigt, talar det starkt för infektionsorsakad diarré. Feber talar också för infektion, men samtidigt är det viktigt att veta att feber kan förekomma vid båda Ulcerös kolit och Crohns skov. Som regel ordineras avföringsodling och andra avföringsprover för att se förekomst av bakterier eller andra mikro-organismer.