Den enda behandlingen är att själva vårtan kan tas bort, men de flesta vårtor försvinner förr eller senare av sig självt. Huvudavsikten med behandlingen skulle i så fall vara att lindra patientens plågor som både kan vara fysisk, kosmetisk och psykosexuell. Det är osäkert om behandlingen i sig reducerar smittsamheten eller tar bort viruset.